1. Sağlıklı bir toplumun olabilmesi sağlıklı çocukların yetiştirilmesi ile mümkündür. Sağlıklı çocuklar ise çocuk hakları gözetilmiş, ihmal ve istismardan korunmuş çocukların yetiştirilmesi ile sağlanabilir. Bu nedenle merkezin misyonu çocukların korunmasında birincil, ikincil ve üçüncül düzeyde korunmaya yönelik önlemlere ilişkin faaliyetler düzenlemek.
  2. Korunma ihtiyacı olan veya suça sürüklenen çocukların ihmal ve istismardan korunması için çalışmak,
  3. Çocuk ihmal ve istismarı ile ilgili güncel durumu takip etmek.
  4. Toplumun daha sağlıklı nesiller oluşturması amacıyla ihmal ve istismarı önlemeye yönelik stratejiler üretmek,
  5. Çocukları ihmal ve istismardan korunmak için devlete bağlı kuruluşlar ve sivil toplum kurumları ile işbirliği yaparak projeleri hayata geçirmek
  6. Çocuk ihmal ve istismarı ile ilgili akademik çalışmalara katkıda bulunmak amacıyla etkinlikler düzenlemektir.